Odbor Centrální harmonizační jednotka vydává Metodický pokyn č. 21 – Směrnice o finanční kontrole (pro orgány veřejné správy). Jedná se o doporučující vzor směrnice o finanční kontrole, který si klade za cíl usnadnit vedoucím orgánu veřejné správy nastavení systému finančního řízení a kontroly uvnitř orgánu veřejné správy. Uveřejněný materiál je možné přizpůsobit různorodosti a specifikům orgánů, které směrnici o finanční kontrole vytváří nebo aktualizují.

Finanční kontrola je upravena zákonem č. 320/2001 Sb., o finanční kontrole ve veřejné správě, který je účinný do 31. prosince 2026. Verze 1.0 metodického pokynu je v souladu s požadavky zákona č. 320/2001 Sb., o finanční kontrole ve veřejné správě. Verze 1.0 nereflektuje požadavky nadcházející právní úpravy účinné od 1. ledna 2027.

S účinností od 1. ledna 2027 je zákon č. 320/2001 Sb., o finanční kontrole ve veřejné správě nahrazen zákonem č. 231/2025 Sb., o řízení a kontrole ve veřejných financí. Aktualizovaná verze 2.0 metodického pokynu reflektuje požadavky zákona č. 231/2025 Sb., o řízení a kontrole ve veřejných financí.